Ecuador cuenta con 383 especies de mamíferos; el último fue identificado en 2013 (Bassaricyon neblina, Olinguito). La disminución de las zonas boscosas, su fragmentación y la caza intensiva han acabado con las poblaciones de pumas, monos aulladores y capuchinos de la zona. El último ciervo fue fusilado en 2009. Desde la creación del proyecto en 2011, Christophe ha prohibido formalmente la caza en el sitio, aplicando así la legislación nacional. Desde entonces, es posible cruzarse con armadillos en el camino, ver coatíes o alguna de las muchas otras especies que se han reapropiado del lugar. La naturaleza está recuperando gradualmente sus derechos, la biodiversidad se está produciendo lentamente.